Du musst deinen Reisepass nicht bei der Immigration abgeben. Du bringst ihn nur zu deinem Biometrics-Termin und nimmst ihn direkt danach wieder mit.
Solange deine Visa-Verlängerung vor Ablauf deines aktuellen Visums eingereicht wurde, entstehen keine Overstay-Gebühren. Für die Immigration zählt das Datum der Einreichung, nicht das Datum der Genehmigung.
Auch wenn dein ursprüngliches Visum während der Bearbeitung abläuft, bist du rechtlich abgesichert.